靶向序列捕获联合高通量测序检测先天性眼外肌纤维化的致病基因突变
贾红艳 焦永红 常青林 华琳 王辉 郭瑞
- 100730 首都医科大学附属北京同仁医院 北京同仁眼科中心 眼科学与视觉科学北京市重点实验室（贾红艳、焦永红、王辉、郭瑞）；100730 首都医科大学附属北京同仁医院医学影像中心（常青林）；100069 首都医科大学生物医学工程学院 生物医学信息学系（华琳）
Using targeted sequence capture and high throughput sequencing to detect pathogenic genes of congenital fibrosis of extraocular muscles
JIA Hong-yan1, JIAO Yong-hong1, CHANG Qing-lin2, HUA Lin3, WANG Hui1, GUO Rui1
- 1. Beijing Tongren Eye Center, Beijing Tongren Hospital, Capital Medical University, Beijing Key Lab. of Ophthalmology and Visual Sciences, Beijing 100730, China; 2. Medical Imaging Center, Beijing Tongren Hospital, Capital Medical University, Beijing 100730, China; 3. Department of Biomedical Information, Biomedical Engineering Institute, Capital Medical University, Beijing 100069, China
摘要：
目的 对中国人先天性眼外肌纤维化（CFEOM）家系和散发个体进行致病基因突变筛查。 设计 实验研究。研究对象 6个CFEOM家系和4个CFEOM散发个体。 方法 收集CFEOM患者的临床及眼运动神经MRI检查资料，采集患者及家庭成员外周静脉血，提取基因组DNA，应用目标序列捕获联合高通量测序的方法对11个疾病候选基因进行全部外显子的突变筛查。生物信息学分析得到候选基因碱基改变后，在100个无关正常对照人群中进行PCR和Sanger测序验证并对基因型和表型特征进行分析。主要指标 基因序列。 结果 80% （8/10）CFEOM先证者存在KIF21A基因突变，分别为c.2860C>T（p.R954W）和c.2861G>A（p.R954Q）；20%（2/10）先证者存在TUBB3基因突变，分别为c.784C>T （p.R262C）和c.1138C>T （p.R380C）。所有突变在家系正常个体及正常对照人群中均未检测到。携带KIF21A基因突变的患者表现为CFEOM1A和CFEOM3B表型，而携带TUBB3基因突变的患者表现出CFEOM3A表型。结论 KIF21A基因突变是中国人CFEOM的常见致病原因。高通量基因筛查可快速、准确地协助疾病的临床诊断和基因分型。（眼科，2016, 25： 400-404）